Vergleiche

Unterschiede

a.SAP verarbeitet Forschungspraktikum Bioinformatik (19400432)

Feld Evento Modulverwaltung Operationen
Beschreibung <h3>Homepage:</h3> <a href="http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/master/forschungspraktikum.html"> http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/master/forschungspraktikum.html</a> <h3>Bitte individuell mit den Betreuern absprechen.</h3>
Englische Beschreibung <h3>Homepage:</h3> <a href="http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/master/forschungspraktikum.html"> http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/master/forschungspraktikum.html</a> <p>Please contact your advisor for further information.</p>
Dozent

Alexander Bockmayr

Tim Conrad

Dorothee Günzel

Camila Mazzoni

Frank Noe

Robert Preissner

Axel Pries

Knut Reinert

Bernhard Renard

Peter N. Robinson

Christof Schütte

Heike Siebert

Alexander Stahn

Martin Vingron

Paul Wrede

Kein Eintrag
SWS 0.00 2.0
Sprache Kein Eintrag Deutsch

a.SAP verarbeitet Rechnergestützte Systembiologie (19400813)

Feld Evento Modulverwaltung Operationen
Englische Beschreibung <h3>Inhalt:</h3> <p>Im Praxisseminar geht es um die Modellierung molekularer Netzwerke mittels diskreter/logischer Methoden. Im Laufe des Semesters werden theoretische Grundlagen erarbeitet, Tools vorgestellt und in Gruppen eigenst&auml;ndig Modelle ausgesuchter Systeme auf Basis von Fachartikeln konstruiert und analysiert.</p> <h3><br /> Zielgruppe:</h3> <p>Studierende im Master Bioinformatik ab dem 2. Semester.</p> <h3>Content:</h3> <p><span style="font-size:10pt">The course focuses on the modeling of molecular networks using discrete/logical approaches. The theoretical framework will be introduced and software tools presented. On the basis of suitable research articles, the participants will conduct their own modeling project in small groups.</span></p> <h3>Target group:</h3> <p>Students of Master Bioinformatics from the 2nd semester.</p>
Englische zusätzliche Informationen <h3>Vorbesprechung:</h3> <p>Die Vorbesprechung findet am 21.04. um 10:15 in 017/A6 statt. Vorl&auml;ufige Zeitangaben, Abstimmung mit Sequenzanalyse m&ouml;glich, endg&uuml;ltige Festlegung bei der Vorbesprechung.</p> <h3><br /> Homepage:</h3> <p>F&uuml;r mehr Informationen und Zeitplan siehe <a href="http://www.mi.fu-berlin.de/w/DiBiMath/WebHome">Lecture Homepage</a>.</p> Kein Eintrag
Sprache Deutsch/Englisch Englisch

a.SAP verarbeitet RNA Bioinformatics (19401111)

Feld Evento Modulverwaltung Operationen
Zusätzliche Informationen <p>Anrechenbar im Forschungsmodul.</p> <p>Weitere Infos im KVV: <a href="https://kvv.imp.fu-berlin.de/portal/">https://kvv.imp.fu-berlin.de/portal/</a></p> <p>Anrechenbar im Forschungsmodul.</p> <p>Weitere Infos im <strong>Site Browser</strong> unter: <a href="https://kvv.imp.fu-berlin.de/portal/">https://kvv.imp.fu-berlin.de/portal/</a></p>
Englische zusätzliche Informationen <p>Creditable for &quot;Forschungsmodul&quot;.</p> <p>For further information see KVV: <a href="https://kvv.imp.fu-berlin.de/portal/">https://kvv.imp.fu-berlin.de/portal/</a></p> <p>Creditable for &quot;Forschungsmodul&quot;.</p> <p>For further information check <strong>Site Browser</strong> on: <a href="https://kvv.imp.fu-berlin.de/portal/">https://kvv.imp.fu-berlin.de/portal/</a></p>

a.SAP verarbeitet Projektmanagement im Softwarebereich (SeqAn) (19401511)

Feld Evento Modulverwaltung Operationen
Titel Projektmanagement im Softwarebereich (SeqAn) Seminar zu Projektmanagement im Softwarebereich (SeqAn)
SAP Titel PMSB-SeqAn (S) S: SWP (SeqAn)
Dozent

Knut Reinert

Hannes Hauswedell

René Rahn

Knut Reinert

a.SAP verarbeitet Projektmanagement im Softwarebereich (SeqAn) (19401513)

Feld Evento Modulverwaltung Operationen
SAP Titel PMSB-SeqAn (P) PraxisS: SWP (SeqAn)
Beschreibung <h3>Inhalt:</h3> <p>In diesem Praktikum werden Algorithmen zur Sequenzanalyse implementiert, und zwar im Rahmen der Software-Bibliothek SeqAn, die zur Zeit in unserer Arbeitsgruppe entwickelt wird. Benotet werden die Beitr&auml;ge anhand eines schriftlichen Projektberichtes.</p> <p>Zum gleichen Modul geh&ouml;rt ein Begleitseminar, das von den Teilnehmern des Praktikums ebenfalls belegt werden muss.</p> <h3>Zielgruppe:</h3> <p>Diese Veranstaltung richtet sich an Studierende der Bioinformatik. Die Praktikumspl&auml;tze werden &uuml;ber ein besonderes Anmeldeverfahren &uuml;ber das Studienb&uuml;ro f&uuml;r Bioinformatik (Ulrike Seyferth) vergeben. Interessierte Informatikstudenten werden nachrangig behandelt.</p> <h3>Voraussetzungen:</h3> <p>Gute Kennnisse in C/C++.</p> <h3>Inhalt:</h3> <p>In diesem Praktikum werden Algorithmen zur Sequenzanalyse implementiert, und zwar im Rahmen der Software-Bibliothek SeqAn, die zur Zeit in unserer Arbeitsgruppe entwickelt wird. Benotet werden die Beitr&auml;ge anhand eines schriftlichen Projektberichtes.</p> <p>Zum gleichen Modul geh&ouml;rt ein Begleitseminar, das von den Teilnehmern des Praktikums ebenfalls belegt werden muss. Bitte entnehmen Sie den Zeitplan aus dessen Beschreibung in unserem Teaching-WiKi: http://www.mi.fu-berlin.de/w/ABI/LectureWiki.</p> <h3>Zielgruppe:</h3> <p>Diese Veranstaltung richtet sich an Studierende der Bioinformatik. Die Praktikumspl&auml;tze werden &uuml;ber ein besonderes Anmeldeverfahren &uuml;ber das Studienb&uuml;ro f&uuml;r Bioinformatik (Ulrike Seyferth) vergeben. Interessierte Informatikstudenten werden nachrangig behandelt.</p> <h3>Voraussetzungen:</h3> <p>Gute Kennnisse in C/C++.</p> <h3>Homepage:</h3> <p><a href="http://www.mi.fu-berlin.de/w/ABI/LectureWiki">http://www.mi.fu-berlin.de/w/ABI/LectureWiki</a></p>
Englische Beschreibung See German version. <p>See German text version.</p>
Dozent

Knut Reinert

Hannes Hauswedell

René Rahn

Knut Reinert

Literatur <h3>Literatur:</h3> <p>Literatur wird in der Vorbesprechung ausgegeben.</p> <h3>Literatur:</h3> <p>Weitere Literatur wird in der Vorbesprechung ausgegeben.</p>
Sprache Kein Eintrag Deutsch
Kapazität 20 6

a.SAP verarbeitet Sequenzanalyse (19401601)

Feld Evento Modulverwaltung Operationen
Englische zusätzliche Informationen Elective course (compulsory optional) for Master students in bioinformatics. <p>Compulsory optional subject in bioinformatics.</p>
Sprache Deutsch Englisch
Kapazität 0 30

a.SAP verarbeitet Netzwerkanalyse (19401701)

Feld Evento Modulverwaltung Operationen
Englische Beschreibung <p>Das Ziel der Veranstaltung ist das Kennenlernen grundlegender mathematischer und algorithmischer Konzepte im Bereich der Modellierung, Simulation und Analyse molekularer Netzwerke im Rahmen der algorithmischen Systembiologie. Die Studierenden lernen eine biologische oder medizinische Fragestellung zu analysieren, zu gegebenen Daten einen passenden Modellierungsansatz auszuw&auml;hlen und umzusetzen, sowie die Ergebnisse zu beurteilen und zu kommunizieren.</p> <p>&nbsp;</p> <h3>Inhalte:</h3> <p>Es werden vertieft Themen aus folgenden Gebieten behandelt:<br /> - Modellierung biochemischer Netzwerke mit gew&ouml;hnlichen Differentialgleichungen<br /> - Diskrete Modellierung regulatorischer Netzwerke<br /> - Constraintbasierte Modellierung metabolischer Netzwerke<br /> - Stochastische und hybride Modellierung</p> <p>&nbsp;</p> Kein Eintrag
Sprache Kein Eintrag Englisch

a.SAP verarbeitet Metabolische Netzwerke (19401801)

Feld Evento Modulverwaltung Operationen
SAP Titel Molekulare Netzwerke (A) Metabolische Netzwerke
Beschreibung <p> The goal of this course is to give an introduction to the most important mathematical and algorithmic ideas underlying the constraint-based analysis of genome-scale metabolic networks, with applications to systems biology and biotechnology.</p><br> <p> We will discuss the steady-state flux cone, flux balance analysis (FBA), flux variability analysis (FVA), flux coupling analysis (FCA), thermodynamic constraints, elementary flux modes (EFMs), and optimality principles for metabolic regulation. On the algorithmic side, the focus will be on linear and mixed-integer optimisation methods.</p> <p>The goal of this course is to give an introduction to the most important mathematical and algorithmic ideas underlying the constraint-based analysis of genome-scale metabolic networks, with applications to systems biology and biotechnology.</p> <p>&nbsp;</p> <p>We will discuss the steady-state flux cone, flux balance analysis (FBA), flux variability analysis (FVA), flux coupling analysis (FCA), thermodynamic constraints, elementary flux modes (EFMs), and optimality principles for metabolic regulation. On the algorithmic side, the focus will be on linear and mixed-integer optimisation methods.</p>
Englische Beschreibung <p> The goal of this course is to give an introduction to the most important mathematical and algorithmic ideas underlying the constraint-based analysis of genome-scale metabolic networks, with applications to systems biology and biotechnology.</p><br> <p> We will discuss the steady-state flux cone, flux balance analysis (FBA), flux variability analysis (FVA), flux coupling analysis (FCA), thermodynamic constraints, elementary flux modes (EFMs), and optimality principles for metabolic regulation. On the algorithmic side, the focus will be on linear and mixed-integer optimisation methods.</p> <p>The goal of this course is to give an introduction to the most important mathematical and algorithmic ideas underlying the constraint-based analysis of genome-scale metabolic networks, with applications to systems biology and biotechnology.</p> <p>&nbsp;</p> <p>We will discuss the steady-state flux cone, flux balance analysis (FBA), flux variability analysis (FVA), flux coupling analysis (FCA), thermodynamic constraints, elementary flux modes (EFMs), and optimality principles for metabolic regulation. On the algorithmic side, the focus will be on linear and mixed-integer optimisation methods.</p> <p>&nbsp;</p>
Sprache Deutsch/Englisch Deutsch

a.SAP verarbeitet Übung zu Metabolische Netzwerke (19401802)

Feld Evento Modulverwaltung Operationen
SAP Titel Übung zu Molekulare Netzwerke (A) Ü: Metabolische Netzwerke
Feld Evento Modulverwaltung Operationen
Titel Projektmanagement im Softwarebereich (Analyse genregulatorischer Netzwerke) Seminar zu Projektmanagement im Softwarebereich (Analyse genregulatorischer Netzwerke)
SAP Titel Projektman i. Softwareber. Metabo. Netzw S: SWP (genreg. Netzwerke)
Feld Evento Modulverwaltung Operationen
SAP Titel Softwarepraktikum PraxisS: SWP (genreg. Netzwerke)
Beschreibung <h3>Homepage:</h3> <a href="http://www.mi.fu-berlin.de/w/AgMathLife/SoftWareProjectSS16">Für weitere Informationen, Termine etc. siehe hier. <h3>Homepage:</h3> <p><a href="http://www.mi.fu-berlin.de/w/AgMathLife/SoftWareProjectSS16">F&uuml;r weitere Informationen, Termine etc. siehe hier.</a></p>
Englische Beschreibung <h3>Homepage:</h3> <a href="http://www.mi.fu-berlin.de/w/AgMathLife/SoftWareProjectSS16">Für weitere Informationen, Termine etc. siehe hier. Kein Eintrag
Kapazität 6 8
Feld Evento Modulverwaltung Operationen
Titel Projektmanagement im Softwarebereich: (Verteiltes Rechnen und Parallelprogrammierung) Seminar zu Projektmanagement im Softwarebereich (Verteiltes Rechnen und Parallelprogrammierung)
SAP Titel PM Softw: Rechn. u. Parallelprogramm. S: SWP (Verteiltes Rechnen)
Submodule

261aA1.1.2

261aA.1.1.2

261bA.1.1.2

Feld Evento Modulverwaltung Operationen
SAP Titel ReaDDy Seminar S: Reaktions-Diffusions Simulationen für
Dozent

Frank Noe

Guillermo Pérez Hernández

Frank Noe

Sprache Deutsch/Englisch Deutsch

a.SAP verarbeitet Berufspraktikum für Bioinformatik (19402433)

Feld Evento Modulverwaltung Operationen
Englische Beschreibung <h3>Zielgruppe:</h3> <p>Studierende im Bachelorstudiengang Bioinformatik</p> <p>Das Berufspraktikum soll nicht vor dem 3. Semester absolviert werden, empfohlen ist die Zeit zwischen 4. und 5. Semester.</p> <h3>Weitere Informationen:</h3> <p><a href="http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/bachelor/studienablauf/berufspraktikum.html">http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/bachelor/studienablauf/berufspraktikum.html</a></p> <p>For further information see:</p> <p><a href="http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/bachelor/studienablauf/berufspraktikum.html">http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/bachelor/studienablauf/berufspraktikum.html</a></p>
Submodule

261aA2.1.1

261bA3.1.1

261aA.2.1.1

Feld Evento Modulverwaltung Operationen
Englische Beschreibung <h3>Weitere Informationen:</h3> <p><a href="http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/bachelor/studienablauf/projektmanagement.html">http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/bachelor/studienablauf/projektmanagement.html</a></p> Kein Eintrag
Englische zusätzliche Informationen <p>Die Platzvergabe hat bereits im Februar stattgefunden. Eine Anmeldung in Campus Management ist au&szlig;erdem erforderlich!</p> Kein Eintrag
Feld Evento Modulverwaltung Operationen
SAP Titel Journal Club Bioinformatik Journal Club Computational Biology
Beschreibung <h3>Inhalt:</h3> <p>In diesem Seminar werden aktuelle Forschungsarbeiten der Bioinformatik sowie die Fortschrittsberichte der PhD-Student*inn*en vorgestellt. Master-Student*inn*en stellen entweder einen ihnen zugewiesenen Zeitschriftenartikel oder ihre Masterarbeit vor oder sie berichten &uuml;ber ihr Fortgeschrittenenpraktikum. Credits werden nur f&uuml;r die Pr&auml;sentation von Artikeln vergeben.</p> <p>Anmeldungen bitte &uuml;ber die <a href="https://kvv.imp.fu-berlin.de/portal/">KVV-Seite</a> (&quot;Site Browser&quot; aufrufen und nach <em>Journal Club</em> suchen).</p> <h3>Inhalt:</h3> <p>In diesem Seminar werden aktuelle Forschungsarbeiten der Bioinformatik sowie die Fortschrittsberichte der PhD-Student*inn*en vorgestellt. Master-Student*inn*en stellen entweder einen ihnen zugewiesenen Zeitschriftenartikel oder ihre Masterarbeit vor oder sie berichten &uuml;ber ihr Fortgeschrittenenpraktikum. Credits werden nur f&uuml;r die Pr&auml;sentation von Artikeln vergeben.</p> <p>Anmeldungen bitte &uuml;ber die <a href="https://kvv.imp.fu-berlin.de/portal/site/62d39acf-91f6-4eb1-a777-2bdb65e11ab3">KVV-Seite des Journal Club</a>.</p>
Englische Beschreibung <h3>Content:</h3> <p>In this seminar we will present original work in Computational biology as well as progress reports from PhD students. Master students will either be assigend a paper, or present their MSc thesis plans and results, or report about their &quot;Fortgeschrittenenpraktikum&quot;. Credits are only awarded for the presentation of papers.</p> <p>Please sign up on the <a href="https://kvv.imp.fu-berlin.de/portal/">KVV pages</a> (open &quot;Site Browser&quot; and look for<em>Journal Club</em>).</p> <h3>Content:</h3> <p>In this seminar we will present original work in Computational biology as well as progress reports from PhD students. Master students will either be assigend a paper, or present their MSc thesis plans and results, or report about their &quot;Fortgeschrittenenpraktikum&quot;. Credits are only awarded for the presentation of papers.</p> <p>Please sign up on the <a href="https://kvv.imp.fu-berlin.de/portal/site/62d39acf-91f6-4eb1-a777-2bdb65e11ab3">KVV pages of the Journal Club</a>.</p>
Literatur Kein Eintrag <h3>Literatur:</h3> <p>aktuelle Publikationen aus der Forschung</p>
Zusätzliche Informationen Englisch / Deutsch <h3>Zielgruppe:</h3> <p>Master- und PhD-Student*inn*en</p>
Englische zusätzliche Informationen English / German <h3>Open for:</h3> <p>Master and PhD students</p>
Sprache Deutsch/Englisch Deutsch
Kapazität 10 0

a.SAP verarbeitet Scientific Computing (19403001)

Feld Evento Modulverwaltung Operationen
Sprache Deutsch Englisch
Feld Evento Modulverwaltung Operationen
Dozent

Hannes Klarner

Heike Siebert

Adam Streck

Hannes Klarner

Heike Siebert

Feld Evento Modulverwaltung Operationen
Beschreibung <h3>Inhalt:</h3> <p>The aim of this project is to extend NuSMV so that it is capable of printing the advanced output. The core NuSMV developers can provide us with support and give proper credits if the feature is integrated in the main release of the tool. We will teach the background of symbolic model checking and its use in systems biology. Good knowledge of C++ is required. </p> <p>For more information and schedule see <a href="http://www.mi.fu-berlin.de/w/DiBiMath/SoftWareProjectSS16">Lecture Homepage</a></p> <p><a href="http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/bachelor/studienablauf/projektmanagement.html">http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/bachelor/studienablauf/projektmanagement.html</a></p> <h3>Weitere Informationen:</h3> <p><a href="http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/bachelor/studienablauf/projektmanagement.html">http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/bachelor/studienablauf/projektmanagement.html</a></p> <p><a href="http://www.mi.fu-berlin.de/w/DiBiMath/SoftWareProjectSS16">Lecture Homepage</a></p>
Englische Beschreibung <h3>Inhalt:</h3> <p>The aim of this project is to extend NuSMV so that it is capable of printing the advanced output. The core NuSMV developers can provide us with support and give proper credits if the feature is integrated in the main release of the tool. We will teach the background of symbolic model checking and its use in systems biology. Good knowledge of C++ is required. </p> <p>For more information and schedule see <a href="http://www.mi.fu-berlin.de/w/DiBiMath/SoftWareProjectSS16">Lecture Homepage</a></p> <p><a href="http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/bachelor/studienablauf/projektmanagement.html">http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/bachelor/studienablauf/projektmanagement.html</a></p> <h3>Inhalt:</h3> <p>The aim of this project is to extend NuSMV so that it is capable of printing the advanced output. The core NuSMV developers can provide us with support and give proper credits if the feature is integrated in the main release of the tool. We will teach the background of symbolic model checking and its use in systems biology. Good knowledge of C++ is required.</p> <p>For more information and schedule see <a href="http://www.mi.fu-berlin.de/w/DiBiMath/SoftWareProjectSS16">Lecture Homepage</a></p>
Dozent

Hannes Klarner

Heike Siebert

Adam Streck

Hannes Klarner

Heike Siebert

Englische zusätzliche Informationen <p>Die Platzvergabe hat bereits im Februar stattgefunden. Eine Anmeldung in Campus Management ist au&szlig;erdem erforderlich!</p> Kein Eintrag

Noch nicht publizierte Kurse

Status LV Kursname
a.Absage verarbeitet 19402111 Projektmanagement im Softwarebereich: (Verteiltes Rechnen und Parallelprogrammierung)

In Evento fehlende Veranstaltungen

LV Kursname
19402113 Projektmanagement im Softwarebereich (Verteiltes Rechnen und Parallelprogrammierung)

In Evento fehlende Begleitveranstaltungen

LV Kursname

In Modulverwaltung fehlende Veranstaltungen

Status LV Kursname